Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Syngr1O55100 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Syngr1O55100 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms