Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Csnk2a2O54833 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Csnk2a2O54833 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms