Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctnnd2O35927 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ctnnd2O35927 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms