Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Opn1mwO35599 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Opn1mwO35599 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Opn1mwO35599 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms