Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc18a3O35304 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Slc18a3O35304 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Slc18a3O35304 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18a3O35304 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms