Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pkd2O35245 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Pkd2O35245 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pkd2O35245 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms