Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RrhO35214 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RrhO35214 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RrhO35214 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RrhO35214 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RrhO35214 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
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RrhO35214 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RrhO35214 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RrhO35214 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RrhO35214 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RrhO35214 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RrhO35214 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RrhO35214 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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RrhO35214 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RrhO35214 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RrhO35214 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RrhO35214 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RrhO35214 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RrhO35214 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RrhO35214 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RrhO35214 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RrhO35214 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RrhO35214 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RrhO35214 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms