Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bhlhe40O35185 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bhlhe40O35185 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms