Protein–RNA interactions for Protein: O09116

Sprr3, Small proline-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr3O09116 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sprr3O09116 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms