Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ascl4M0QW46 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ascl4M0QW46 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms