Protein–RNA interactions for Protein: L7N292

Gm3573, Predicted gene 3573, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3573L7N292 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm3573L7N292 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm3573L7N292 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms