Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20939L7N243 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm20939L7N243 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms