Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H2al1oL7MU04 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
H2al1oL7MU04 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms