Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm2056J3QQ02 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm2056J3QQ02 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms