Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS2

1700014D04Rik, MCG148436, mousemouse

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700014D04RikJ3QMS2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
1700014D04RikJ3QMS2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
1700014D04RikJ3QMS2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.7 ms