Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm21897J3KMP5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm21897J3KMP5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms