Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tubgcp6G5E8P0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tubgcp6G5E8P0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tubgcp6G5E8P0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms