Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vmn1r67G5E8C1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Vmn1r67G5E8C1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms