Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp2b1G5E829 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp2b1G5E829 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms