Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nccrp1G3X9C2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nccrp1G3X9C2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms