Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NpcdF8VQB8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NpcdF8VQB8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NpcdF8VQB8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms