Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ScaperF8VQ70 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ScaperF8VQ70 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ScaperF8VQ70 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms