Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
5830473C10RikF8VQ07 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
5830473C10RikF8VQ07 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms