Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Ercc6F8VPZ5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Ercc6F8VPZ5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ercc6F8VPZ5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms