Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Arid4aF8VPQ2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Arid4aF8VPQ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms