Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zfp946F6VWU8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zfp946F6VWU8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms