Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm21977F6U3N7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21977F6U3N7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms