Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Syngap1F6SEU4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Syngap1F6SEU4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms