Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Rnf165E9QAU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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Rnf165E9QAU8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Rnf165E9QAU8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Rnf165E9QAU8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
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Rnf165E9QAU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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Rnf165E9QAU8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf165E9QAU8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms