Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc146E9Q9F7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccdc146E9Q9F7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccdc146E9Q9F7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms