Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd35E9Q9D8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ankrd35E9Q9D8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ankrd35E9Q9D8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ankrd35E9Q9D8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms