Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Simc1E9Q6E9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Simc1E9Q6E9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms