Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
5031410I06RikE9Q4E0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
5031410I06RikE9Q4E0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC24■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
5031410I06RikE9Q4E0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms