Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Pdzd2E9Q1M1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Pdzd2E9Q1M1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdzd2E9Q1M1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pdzd2E9Q1M1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzd2E9Q1M1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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