Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm3893E9Q1I1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm3893E9Q1I1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm3893E9Q1I1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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