Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ8

E430018J23Rik, RIKEN cDNA E430018J23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E430018J23RikE9PZQ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
E430018J23RikE9PZQ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
E430018J23RikE9PZQ8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms