Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Brd1E9PZ26 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Brd1E9PZ26 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms