Protein–RNA interactions for Protein: E9PUT9

Gm3252, Predicted gene 3252, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3252E9PUT9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3252E9PUT9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3252E9PUT9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3252E9PUT9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Gm3252E9PUT9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3252E9PUT9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3252E9PUT9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3252E9PUT9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3252E9PUT9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms