Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Klhl3E0CZ16 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Klhl3E0CZ16 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms