Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
3425401B19RikD3Z1D3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
3425401B19RikD3Z1D3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
3425401B19RikD3Z1D3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms