Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ1

Ldlrad1, Low density lipoprotein receptor class A domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad1D3YYZ1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ldlrad1D3YYZ1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ldlrad1D3YYZ1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms