Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SafbD3YXK2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SafbD3YXK2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms