Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BC048679D3YXE9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BC048679D3YXE9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms