Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmf1B9EKI3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmf1B9EKI3 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
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