Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Cttnbp2B9EJA2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Cttnbp2B9EJA2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Cttnbp2B9EJA2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms