Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cyp26c1B2RXA7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cyp26c1B2RXA7 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms