Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cfap58B2RW38 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap58B2RW38 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms