Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Clrn2B2RVW2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Clrn2B2RVW2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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