Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hbb-bh2B2RVB7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms