Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rd3lB2RV38 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rd3lB2RV38 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms